南通市海门区政府办公室设下列内设机构：
（一）综合科（区政府总值班室）
（二）调研科
（三）秘书一科
（四）秘书二科
（五）秘书三科
（六）秘书四科
（七）秘书五科
（八）区政府督查室
（九）外事科
（十）法制和政务公开科
